sMRIPrep（结构 MRI PREProcessing）管道
项目描述
sMRIPrep是一种结构磁共振成像 (sMRI) 数据预处理管道，旨在提供易于访问、最先进的界面，该界面对扫描采集协议的变化具有鲁棒性，并且需要最少的用户输入，同时提供易于解释以及全面的错误和输出报告。它执行基本处理步骤（对象平均、B1 场校正、空间归一化、分割、去颅骨等），提供可以轻松连接到后续工具（如 fMRIPrep或 dMRIPrep ）的输出。
该工作流程基于Nipype，并包含来自知名软件包的工具组合，包括 FSL、 ANTs、 FreeSurfer和AFNI。
更多信息和文档可以在 https://www.nipreps.org/smriprep/找到。在neurostars.org上提供支持。
原则
sMRIPrep围绕三个原则构建：
鲁棒性- 管道根据输入数据集调整预处理步骤，并应提供尽可能好的结果，与扫描仪制造、扫描参数或是否存在额外的校正扫描（例如场图）无关。
易于使用- 由于依赖于 BIDS 标准，手动参数输入减少到最低限度，允许管道以自动方式运行。
“玻璃盒”理念——自动化不应该意味着人们不应该目视检查结果或理解方法。因此，sMRIPrep为每个受试者提供视觉报告，详细说明最重要处理步骤的准确性。这与文档相结合，可以帮助研究人员了解该过程并决定应保留哪些主题以进行组级分析。
致谢
请通过明确提及此软件的名称 (sMRIPrep) 和版本以及指向GitHub 存储库或 Zenodo 参考的链接 (doi: 10.5281/zenodo.2650521 ) 来确认这项工作。
