语义标签变得简单
项目描述
描述
一种高度适应性的工具,用于可视化和生成通用图像的语义注释。
大多数用于语义(像素级)标记的软件解决方案都是为感兴趣的组件少于 10 个的低分辨率(<10MB)图像设计的。违反任一约束(例如使用高分辨率图像或注释约 1000 个组件)都会对性能产生不利影响。S3A 旨在解决这两个缺陷。该工具具有高达 150 MB 的图像和 2000 个组件,可保持交互性。
可以在此处的项目 wiki 中找到更详细的概述。
安装
最简单的安装方法s3a是pip在克隆存储库之后,或者直接从 pypi:
git clone https://gitlab.com/ficsresearch/s3a
pip install -e ./s3a
# Or from pypi using "pip install s3a"
请注意,要使 S3A 工作,需要一个版本的 OpenCV 和 Qt 绑定。可以使用“完整”选项为您安装这些:
pip install -e ./s3a[full]
# Or "pip install s3a[full]"
运行应用程序
运行应用程序就像调用s3a模块或使用提供的入口点一样简单:
python -m s3a
或者,等效地:
s3a-gui
从这里,可以创建项目来托管相关图像组,或者可以在默认项目中注释图像。这两个选项都可以通过File菜单获得。
详细功能列表
项目 wiki中概述了有关此工具功能的更多信息。
请注意
S3A 的程序化 API 仍在很大程度上处于开发阶段。它仍然需要改进以允许一致的命名方案、删除残留元素、确认私有元素与面向公众的元素以及其他一些项目。但是,图形界面应该受这些更改的影响最小。
因此,虽然 GUI 入口点应该始终有用,但在详细使用 S3A 的脚本部分时要注意这些发展。
执照
此工具可免费用于个人和商业用途(所选 Qt 绑定所施加的限制除外)。如果您根据通过此应用程序获得的结果发布某些内容,请引用以下论文:
Jessurun, N., Paradis, O., Roberts, A. 和 Asadizanjani, N. (2020)。组件检测和评估框架 (CDEF):一种语义注释工具。显微镜和微量分析,1-5。doi:10.1017/S1431927620018243
项目详情
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