用于读取 GROMACS .trr 文件的包
项目描述
pytr
pytrr是一个 Python 包,用于从 GROMACS [ 2 ]读取 .trr [ 1 ]文件。
pytrr旨在作为一个轻量级的纯 Python 库,用于读取 .trr 轨迹,它可以访问位置、速度等作为 numpy 数组。
例子
from pytrr import GroTrrReader
with GroTrrReader('traj.trr') as trrfile:
for frame in trrfile:
print(frame['step'])
frame_data = trrfile.get_data()
print(frame_data['x'][0])
安装
pytrr 可以通过 pip 安装:
点安装 pytrr