从 MetaNetX (https://metanetx.org) 解析和清理信息。
项目描述
使用Identifiers.org命名空间解析和处理来自MetaNetX的 信息以实现MIRIAM兼容性 。
安装
它很简单:
pip install metanetx-sdk
用法
有关如何使用各种命令的权威来源始终可以通过命令的帮助访问。
mnx-sdk -h
通常你会从从 MetaNetX FTP 服务器加载文件开始
mnx-sdk pull ./data
然后转换每个数据表。
mnx-sdk etl chem-prop ./data/chem_prop.tsv.gz ./data/transformed_chem_prop.tsv.gz
您也可以直接使用metanetx_sdk.api模块中的函数。
版权
版权所有 © 2019-2020,Moritz E. Beber。
根据Apache 软件许可证 2.0分发的免费软件。
项目详情
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定要选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。
源分布
metanetx-sdk-4.2.0.tar.gz
(18.0 kB
查看哈希)
内置分布
metanetx_sdk-4.2.0-py2.py3-none-any.whl
(30.0 kB
查看哈希)
关
metanetx_sdk -4.2.0-py2.py3-none-any.whl 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 504add40ba1ac4132d059b0e27757f7a7d47d5f1b4dd472f3519b6fae15e5302 |
|
| MD5 | 87bc1ab65db02cd8784bd2beb02735f8 |
|
| 布莱克2-256 | 4d4d655660f172d6b83632a38772aeb12ab4827c07fe9cb704ff5e346ae4844b |