将 seurat obj 转换为 Adata
项目描述
将 Seurat Obj (rds) 转换为 Scanpy obj (adata)
用法：
conda enve create -f env.yaml
conda activate seuratToAdata
usage: seuratToAdata [-h] -o OUTPUT [--RNA] rds
positional arguments:
rds Use - for STDIN or path for seurat obj(*.rds file)
optional arguments:
-h, --help show this help message and exit
-o OUTPUT, --output OUTPUT
Specify path to write the results (default: None)
--RNA Whether is store in the RNA slot (default: False)
可能会出现问题：
-
UnicodeDecodeError：“ascii”编解码器无法解码位置 1 中的字节 0xcf：序数不在范围内（128）。
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定要选择哪个，请了解有关安装包的更多信息。
源分布
seuratToAdata-0.0.6.tar.gz
（3.8 kB
查看哈希）
内置分布
seuratToAdata-0.0.6-py3-none-any.whl
（4.4 kB
查看哈希）
关
seuratToAdata -0.0.6.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | b67de9d06a4b292a16d157fa82ade41f2bfa9ad4d812413af44a20cc70746743 |
|
| MD5 | a0bf441df99b4f9624cec8a66a164001 |
|
| 布莱克2-256 | b2a3fca319deda3b0bdc68d80e6c798f7ebac8a00b707c4a0418801ca985578d |
关
seuratToAdata -0.0.6-py3-none-any.whl 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | bd7fb7186ed29dfa620f81c9f527c53dad98b327a77fc94d3971974a96825036 |
|
| MD5 | 1395c3ac35831f98ad332ba26c74fcd6 |
|
| 布莱克2-256 | 6cc56f8552df84a3668cd9b01399273c9edaac6b722bc31fce9206287eb47717 |