Resolwe 平台的生物信息学管道
项目描述
用于Django 框架的Resolwe数据流包的生物信息学管道。
文档和帮助
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安装
先决条件
确保您的系统上安装了Python 3.6。如果您还没有，请按照这些说明进行操作。
Resolwe 需要PostgreSQL (9.4+)。许多 Linux 发行版已经包含所需的 PostgreSQL 版本（例如 Fedora 22+、Debian 8+、Ubuntu 15.04+），您可以通过发行版的包管理器简单地安装它。否则，请遵循这些说明。
此外，从PyPI安装一些（间接）依赖项将需要在系统上安装 C 编译器（例如GCC）以及 Python 开发文件。
笔记
安装 C 编译器和 Python 开发文件的首选方法是使用发行版的包（如果存在）。例如，在基于 Fedora/RHEL 的系统上，这意味着安装gcc和 python3-devel包。
使用PyPI
pip install resolwe-bio要安装预发行版，请使用：
pip install --pre resolwe-bio使用GitHub 上的源代码
pip install --pre https://github.com/genialis/resolwe-bio/archive/<git-tree-ish>.tar.gz其中<git-tree-ish>可以表示Resolwe Bioinformatics 的 GitHub 存储库中的任何提交 SHA、分支名称、标签名称等。例如，要从master分支安装最新的 Resolwe Bioinformatics，请使用：
pip install --pre https://github.com/genialis/resolwe-bio/archive/master.tar.gz贡献
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