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用于处理以 NWB 格式存储的神经数据的软件包

项目描述

docs/source/figures/logo_pynwb.png

PyNWB 是一个用于处理 NWB 文件的 Python 包。PyNWB 文档可以在https://pynwb.readthedocs.io找到

最新发布的

https://badge.fury.io/py/pynwb.svg https://anaconda.org/conda-forge/pynwb/badges/version.svg

构建状态

Linux

Windows 和 MacOS

https://circleci.com/gh/NeurodataWithoutBorders/pynwb.svg?style=shield https://dev.azure.com/NeurodataWithoutBorders/pynwb/_apis/build/status/NeurodataWithoutBorders.pynwb?branchName=dev

康达

https://circleci.com/gh/conda-forge/pynwb-feedstock.svg?style=shield

总体健康

https://github.com/NeurodataWithoutBorders/pynwb/workflows/Run%20coverage/badge.svg https://codecov.io/gh/NeurodataWithoutBorders/pynwb/branch/dev/graph/badge.svg 需求状态 文件状态 PyPI - 许可证

NWB 格式 API

PyNWB 是一个用于处理 NWB 文件的 Python 包。它提供了一个高级 API,可有效处理以NWB 格式存储的 Neurodata 。

无国界神经数据:神经生理学 (NWB:N)是一个为基于细胞的神经生理学数据开发统一数据格式的项目,重点关注在大范围实验条件下测量的神经元组的动态。

NWB:N 团队由神经科学家和软件开发人员组成,他们认识到采用统一的数据格式是打破神经科学数据共享障碍的重要一步。

安装

有关详细信息,请参阅 PyNWB 文档http://pynwb.readthedocs.io/en/latest/getting_started.html#installation

行为守则

这个项目和参与其中的每个人都受我们的行为准则指导。通过参与,您应该遵守此准则。

贡献

有关如何为 PyNWB 做出贡献的详细信息,请参阅我们的贡献指南

引用 NWB

  • 手稿: Oliver Rübel、Andrew Tritt、Ryan Ly、Benjamin K. Dichter、Satrajit Ghosh、Lawrence Niu、Ivan Soltesz、Karel Svoboda、Loren Frank、Kristofer E. Bouchard,“神经生理学数据科学的无国界神经数据生态系统”,bioRxiv 2021.03 .13.435173,2021年3月15日,doi:https ://doi.org/10.1101/2021.03.13.435173

  • RRID:(PyNWB,RRID:SCR_017452)

执照

“pynwb” 版权所有 (c) 2017-2022,加利福尼亚大学董事会,通过劳伦斯伯克利国家实验室(需获得美国能源部的任何必要批准)。版权所有。如果满足以下条件,则允许以源代码和二进制形式重新分发和使用,无论是否经过修改:

  1. 源代码的再分发必须保留上述版权声明、此条件列表和以下免责声明。

  2. 二进制形式的再分发必须在随分发提供的文档和/或其他材料中复制上述版权声明、此条件列表和以下免责声明。

  3. 未经事先明确的书面许可,不得使用加利福尼亚大学劳伦斯伯克利国家实验室、美国能源部的名称或其贡献者的名称来认可或推广源自本软件的产品。

本软件由版权所有者和贡献者“按原样”提供,并且不提供任何明示或暗示的保证,包括但不限于对适销性和特定用途适用性的暗示保证。在任何情况下,版权所有者或贡献者均不对任何直接、间接、偶然、特殊、惩戒性或后果性损害(包括但不限于采购替代商品或服务;使用、数据或利润损失;或业务中断),无论是由何种责任理论引起的,无论是在合同、严格责任或侵权行为(包括疏忽或其他方式)中以任何方式使用本软件引起的,即使已被告知存在此类损害的可能性。

您没有义务向任何人提供源代码的特性、功能或性能的任何错误修复、补丁或升级(“增强”);但是,如果您选择公开或直接向劳伦斯伯克利国家实验室提供您的增强功能,而无需为此类增强功能强加单独的书面许可协议,那么您特此授予以下许可:非排他性、免版税的永久许可以二进制和源代码形式安装、使用、修改、准备衍生作品、并入其他计算机软件、分发和再许可此类增强或衍生作品。

项目详情


下载文件

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源分布

pynwb-2.1.0.tar.gz (459.4 kB 查看哈希

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内置分布

pynwb-2.1.0-py2.py3-none-any.whl (118.7 kB 查看哈希

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