在标准 Python 2.7 解释器中使用 UCSF Chimera Python API。
项目描述
在任何 Python 2.7 解释器中使用 UCSF Chimera 包
使用 PyChimera，您可以……
使用pychimera script.py从 CLI根据嵌合体运行脚本。
在 UCSF Chimera 之外的交互式编码会话中启用import chimera，包括 IPython 和 Jupyter Notebooks。
启动一个标准的 UCSF Chimera 实例，使用pychimera --gui导入所有conda或virtualenv包。
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文档
更新的文档始终在readthedocs上可用。
致谢
主要基于Greg Couch 在 chimera-users的想法。
引文
PyChimera 是科学软件，由公共研究资助（西班牙 MINECO 的项目CTQ2014-54071-P、Generalitat de Catalunya 的项目2014SGR989和研究资助2017FI_B2_00168、COST Action CM1306）资助。如果您在科学出版物中使用 PyChimera，请引用它。它将有助于衡量我们研究的影响并确保未来的资金！
@article{pychimera2018,
author = {Rodríguez-Guerra Pedregal, Jaime and Maréchal, Jean-Didier},
title = {PyChimera: use UCSF Chimera modules in any Python 2.7 project},
journal = {Bioinformatics},
volume = {34},
number = {10},
pages = {1784-1785},
year = {2018},
doi = {10.1093/bioinformatics/bty021},
URL = {http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty021},
eprint = {/oup/backfile/content_public/journal/bioinformatics/34/10/10.1093_bioinformatics_bty021/1/bty021.pdf}
}
