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钙成像和行为分析

项目描述

caliban:钙成像和行为分析

……在梦中,
乌云会打开,显示财富
准备降落在我身上;那个,当我醒来时,
我哭着再次做梦。

暴风雨,第三幕,第二场

闪烁的钙成像视频肯定充满了财富。鉴于 Caliban 在沉睡中的财富如雨后春笋般涌现,我们必须更加努力地挖掘这些数据集。该软件旨在帮助其他任性的旅行者了解神经元如何编码信息。

编写此代码库的目的是用作以下工具箱:

  1. 按行为对神经元分类进行统计测试。
  2. 神经活动和行为数据的可视化
  3. 神经元网络的图论分析。
  4. 数据可视化工具——查看通过整合钙成像电影、行为视频和数据处理结果的实验​​获得的数据的“全貌”。
  5. 使用 Google Colab 笔记本处理行为数据

对于任何功能请求,请创建一个问题

Google Colab 入门

该包可以通过以下方式在 Google Colab 上运行

!pip install jb-caliban

对于开发人员:

git clone -b dlc_pypi https://<your_github_token>@github.com/GergelyTuri/caliban.git
%cd caliban
!git pull
!pip install .

故障排除

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项目详情


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源分布

jb-caliban-0.0.16.tar.gz (146.0 kB 查看哈希

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内置分布

jb_caliban-0.0.16-py3-none-any.whl (157.6 kB 查看哈希

已上传 py3