使用单细胞数据进行计算机基因扰动分析和 GRN 分析
项目描述
CellOracle 是一个 python 库，用于使用单细胞组学数据和基因调控网络模型进行计算机基因扰动分析。
如需更多信息，请阅读我们的 bioRxiv 预印本：CellOracle：通过网络推理和计算机基因扰动剖析细胞身份。
文档、代码和教程
可通过以下链接获得 CellOracle 文档。
问题和错误
如果您有疑问、错误、错误或问题，请使用Github 问题页面。
支持的物种和参考基因组
人类：['hg38', 'hg19']
鼠标：['mm39', 'mm10', 'mm9']
酿酒酵母：[“sacCer2”，“sacCer3”]
斑马鱼：[“danRer7”、“danRer10”、“danRer11”]
非洲爪蟾：[“xenTro2”、“xenTro3”]
大鼠：[“rn4”、“rn5”、“rn6”]
果蝇：[“dm3”，“dm6”]
C.elegans：[“ce6”，“ce10”]
拟南芥：[“TAIR10”]
鸡：[“galGal4”、“galGal5”、“galGal6”]
豚鼠：[“Cavpor3.0”]
如果您需要其他参考基因组，请通过Github 问题页面告知我们。
变更日志
请到这个页面。
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定要选择哪个，请了解有关安装包的更多信息。
源分布
celloracle-0.10.11.tar.gz
（10.0 MB
查看哈希）
内置分布
celloracle-0.10.11-py3-none-any.whl
（10.2 MB
查看哈希）
关
celloracle -0.10.11.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 226dc6ef2b9d18a4817cbb163a1c413d794f4522d1f715ee016367d3bf81dcde |
|
| MD5 | 46a8b152414205aedc6333808d0b8b1b |
|
| 布莱克2-256 | 5e78f20a34ce9777489c76f029a05bee085886c4a42399a2674bee9d49528066 |
关
celloracle -0.10.11-py3-none-any.whl 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | bd2eda83a86446b5aa2370876df7f766d26d7b6b823fcf3ffa400a7195799f2f |
|
| MD5 | 77f04ba2e8334e6a23eb606b71a8cca0 |
|
| 布莱克2-256 | 59c547541a695acab6883b7bca38fd8dfd7669286d8685377b9c453b9fd384ea |